以西學、東學、中學為支點,打破分科治學的局限,不以變化為進化,不以現在為現代,從多學科的角度,用不分科的觀念方法,全面探究近代以來中國的概念、思想、學科、制度轉型的全過程和各層面,溝通古今中外,解析西學與東學對於認識中國歷史文化的格義附會,重建中國自己的話語系統和條理脈絡,深入認識中華民族新的智慧生成運作機制形成的進程、狀態和局限,認識世界一體化進程中東亞文明的別樣性及其對人類發展提供多樣選擇的價值,爭取和保持對於世界文明發展日顯重要的中國歷史文化解釋的主動和主導地位。近代學術的清學糾結,折射出整個近代中國在中外文化衝突融合的纏繞中遭遇的困境。透過目前的習以為常,依稀可見曾經陣痛的脫胎換骨。在此過程中,看似兼收並蓄,其實外來學說的輸入不免表淺變形,本來民族的地位則多有流失。