摩爾根的《基因論》,為生物學實現新的理論綜合奠定了堅實的基礎,不但推動了細胞學的發展,還將生物學研究從細胞水準提升到了分子水準。《基因論》的出版問世,使得遺傳學向生物學的其他學科滲透成為大趨勢。
其主要內容為:第一章到第四章,探究基因在染色體上的位置和作用,提出基因連鎖群的概念及其交換機制;第五章到第六章,進一步研究突變性狀的起源,探究突變性狀和基因缺失之間的關係以及多等位基因;第七章到第十三章,主要是對由染色體數目的成倍增加所得來的單倍體、三倍體、四倍體、多倍體進行探討,此外,還對因染色體不規則增減而出現的異倍體,以及種間雜交時染色體數目的變化進行了深入探討;第十四章到第十七章,對性別決定機制、性中型以及性逆轉進行論述;第十八章到第十九章,回顧全書,並得出基因具有高度穩定性這一濃縮性結論。