中醫病因是聯結中醫理論與中醫臨床的橋樑性知識,然而,最新版的《中醫基礎理論》教材關於中醫病因的內容卻只有24頁紙,約3.5萬字的內容,將病因分為外感病因、內傷病因、病理產物性病因和其他病因4類,介紹各類病因的致病特點。但是,中醫病因的生物學基礎及其致病機制並不清楚。
中醫病因學是一門研究致病因素的客觀實在及其致病機制的中醫基礎學科。
傳統中醫學命名了少量的疾病,如瘧疾、痢疾、天花,但更關注大量的症狀和症狀組合(即證候);現代西醫學描述了少量的症狀,如發熱、疼痛、發紺,但更強調大量的疾病和症狀組合(即綜合征),如何使傳統中醫學的症狀、證候與現代西醫學的疾病、綜合征相互融通是我們必須面對的關鍵科學問題。