日本禪僧“脫佛入儒”歷史過程,經歷了中世由以公家、武家和僧侶階層為主導的佛教文化向近世以儒學為宗的德川幕府意識形態轉變的較長歷史時期。就其內在理路和發生脈絡而言,該過程大致呈現出了理論上的“排儒斥朱”“儒釋調和”“儒釋道三教一致”“排佛歸儒”和行動上的“脫佛還俗”。
其中,尤具代表性的是出身相國寺的藤原惺窩、出身建仁寺的林羅山和出身妙心寺的山崎暗齋“脫佛入儒”,高舉朱子學之大纛,招徒講學,致力於儒學在日本的傳播。這一情形不僅反映了中世佛教文化向近世以儒學為宗的政治意識形態和學術思想的轉變與趨向,也開啟了儒學“日本化”的歷史進程。