金門縣政府，為中華民國福建省金門縣最高層級的最高地方行政機關，在中華民國政府架構中為縣自治的行政機關，同時負責執行中央機關委辦事項，金門縣的自治監督機關為行政院各部會。金門縣政府也是轄下各鄉、鎮的地方自治監督機關。金門縣政府設有11個所屬一級單位、7個所屬一級機關、17個所屬二級機關、23所各級學校、1所幼兒園。此外，金門縣政府還經營5個縣營事業機構。
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