分子生物學(原書第五版)

譯者序
序言
致謝
分子生物學實驗技術目錄

第Ⅰ部分 導論
第1章 分子生物學簡史
1.1傳遞遺傳學
孟德爾的遺傳定律
遺傳的染色體理論
遺傳重組和遺傳定位
重組的物理學證據
1.2分子遺傳學
DNA的發現
基因和蛋白質之間的關係
基因的行為
1.3生命的三個域
第2章 基因的分子特性
2.1遺傳物質的特性
細菌轉化
多核苷酸的化學本質
2.2 DNA結構
實驗背景
雙螺旋
2.3 RNA基因
2. 4 核酸的物理化學性質
DNA結構的多樣性
不同大小和形狀的DNA
第3章 基因功能簡介
3.1 儲存資訊
基因表達的總體過程
蛋白質結構
蛋白質功能
信使RNA的發現
轉錄
翻譯
3.2複製
3.3 突變
鐮狀細胞貧血病

第Ⅱ部分 分子生物學方法
第4章 分子克隆方法
4.1 基因克隆
限制性內切核酸酶的作用
載體
用特異性探針鑒定目的克隆
cDNA克隆
cDNA末端快速擴增
4.2 聚合酶鏈反應
標準PCR
用反轉錄酶PCR進行cDNA克隆
即時定量PCR
4.3 表達克隆基因的方法
表達載體
其他真核載體
利用Ti質粒將基因導入植物
第5章 研究基因和基因活性的分子工具
5.1分子的分離
凝膠電泳
雙向凝膠電泳
離子交換層析
凝膠過濾層析
親和層析
5.2 示蹤標記
放射自顯影
磷屏成像
液體閃爍計數器
非放射性示蹤
5.3 核酸雜交的應用
Southern印跡：鑒定特異DNA片段
DNA指紋和DNA分型
DNA指紋和DNA分型在法醫學中的應用
原位雜交：基因在染色體中的定位
免疫印跡（Western印跡）
5.4 DNA測序和物理圖
Sanger鏈末端終止測序法
自動化DNA測序
高通量測序
限制圖
5.5基於克隆基因的蛋白質工程：定點誘變
5.6 圖譜定位與轉錄物定量
Northern印跡
S1核酸酶作圖
引物延伸法
截斷轉錄和無G盒轉錄
5.7 測定體內轉錄速率
細胞核連綴轉錄
報告基因轉錄
測定體內蛋白質積累
5.8 分析DNA－蛋白質相互作用
濾膜結合
凝膠阻滯
DNA酶足跡
DMS足跡法和其他足跡法
染色質免疫沉澱（ChIP）
5.9蛋白質－蛋白質相互作用研究
5.10 尋找與其他分子相互作用的RNA序列
SELEX
功能SELEX
5.11 基因敲除和轉基因
基因敲除小鼠
轉基因小鼠

第Ⅲ部分 原核生物的轉錄
第6章 細菌的轉錄機制
6.1 RNA聚合酶的結構
σ亞基是一種特異性因數
6.2 啟動子
RNA聚合酶與啟動子的結合
啟動子結構
6.3 轉錄起始
σ因數促進轉錄起始
σ因數的再利用
σ迴圈的隨機模型
啟動子處DNA的局部解鏈
啟動子清除
σ因數的結構和功能
α亞基在UP元件識別中的功能
6.4 延伸
核心酶在延伸過程中的作用
延伸複合體的結構
6.5轉錄的終止
Rho非依賴型終止
Rho依賴型終止
第7章 操縱子：細菌轉錄的精細調控
7.1 lac操縱子
lac操縱子的負調控
操縱子的發現
阻遏物與操縱基因間的相互作用
阻遏機制
lac操縱子的正調控
CAP的作用機制
7.2 ara操縱子
ara操縱子的阻遏環
ara操縱子阻遏環的證據
araC的自主調節
7.3 trp操縱子
色氨酸在trp操縱子負調控中的作用
衰減作用對trp操縱子的調控
衰減作用的失效
7.4核糖開關
第8章 細菌轉錄機制的主要轉換模式
8.1 σ因數的轉換
噬菌體感染
孢子形成
擁有多啟動子的基因
其他σ因數的轉換
抗σ因數
8.2 T7噬菌體所編碼的RNA聚合酶
8.3 λ噬菌體對E.coli的感染
λ噬菌體的裂解繁殖
溶源態的建立
溶源期cI基因的自我調節
被λ噬菌體感染後寄主命運的決定：裂解或溶源
溶源菌的誘導
第9章 細菌中DNA－蛋白質的相互作用
9.1 λ阻遏物家族
利用定點突變探測結合的專一性
λ阻遏物－操縱基因相互作用的高解析度分析
434噬菌體阻遏物－操縱基因相互作用的高解析度分析
9.2 trp阻遏物
色氨酸的作用
9.3 對蛋白質－DNA相互作用的一般性認識
四個不同堿基對的氫鍵形成能力
多聚DNA結合蛋白的重要性
9.4 DNA結合蛋白：遠程作用
Gal操縱子
重複的λ操縱基因
增強子

第Ⅳ部分 真核生物的轉錄
第10章 真核生物的RNA聚合酶及其啟動子
10.1 真核生物RNA聚合酶的多種形式
三類細胞核聚合酶的分離
三類RNA聚合酶的作用
RNA聚合酶亞基結構
10.2 啟動子
Ⅱ類啟動子
Ⅰ類啟動子
Ⅲ類啟動子
10.3 增強子與沉默子
增強子
沉默子
第11章 真核生物中的通用轉錄因數
11.1 Ⅱ類因數
Ⅱ類預起始複合物
TFIID的結構和功能
TFIIB的結構和功能
TFIIH的結構和功能
仲介物複合體和RNA聚合酶Ⅱ全酶
延伸因數
11.2 I類因數
核心結合因數
UPE結合因數
SL1的結構和功能
11.3 Ⅲ類因數
TFIIIA
TFIIIB和TFIIIC
TBP的作用
第12章 真核生物的轉錄啟動因數
12.1 啟動因數的類型
DNA結合域
轉錄啟動域
12.2 啟動因數DNA結合模體的結構
鋅指結構
GAL4蛋白
細胞核受體
同源異型域
亮氨酸拉鍊和螺旋－環－螺旋域
12.3啟動因數各功能域的獨立性
12.4 啟動因數的功能
TFIID的募集作用
聚合酶全酶的募集
12.5 啟動因數間的相互作用
二聚化作用
遠程作用
轉錄工廠
複合增強子
結構轉錄因數
增強體
絕緣子
12.6 轉錄因數的調控
輔啟動因數
啟動因數的泛素化
啟動因數的SUMO修飾
啟動因數的乙醯化
信號轉導途徑
第13章 染色質結構及其對基因轉錄的影響
13.1染色質結構
組蛋白
核小體
30nm纖絲
染色質折疊的更高級結構
13.2 染色質結構與基因活性
組蛋白對Ⅱ類基因轉錄的影響
核小體定位
組蛋白乙醯化
組蛋白去乙醯化
染色質重建
異染色質與沉默
核小體與轉錄的延伸

第Ⅴ部分 轉錄後加工
第14章 RNA加工I：剪接
14.1 斷裂基因
有關斷裂基因的證據
RNA剪接
……
第Ⅶ部分 DNA複製、重組和轉座
第Ⅷ部分 基因組